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建设工程施工合同被确认为无效后，在工程质量合格的情况下，对于工程价款的结算，《民法典》及《新司法解释（一）》均明确了折价补偿原则，即参照合同关于工程价款的约定折价补偿承包人。在进行折价补偿时，首先应以双方实际履行的合同为折价依据，当双方对实际履行的合同产生争议时，就要结合双方实际履行过程中形成的签证、函件、通知、会议纪要、进度款申报表、施工内容、施工图纸、施工质量标准、结算文件等证据，对比双方签订的多份合同之间差异、矛盾之处，综合分析判断发包人和承包人实际履行的是哪一份合同；而在根据各种因素确实无法确定实际履行合同时，则推定当事人最后签订的合同为其最新且真实的意思表示。
